中華穿山甲（Manis pentadactyla）分布于尼泊爾、錫金、緬甸和越南北部以及我國(guó)長(zhǎng)江以南地區(qū)。因棲息地喪失、過(guò)度利用、氣候變化等因素，種群處于極度瀕危狀態(tài)，被列入國(guó)家一級(jí)重點(diǎn)保護(hù)野生動(dòng)物名錄，是我國(guó)生物多樣性保護(hù)的旗艦物種。目前，該物種保護(hù)遺傳學(xué)研究局限于云南、廣東、臺(tái)灣等地種群，限制了中華穿山甲的科學(xué)保護(hù)與管理。
為了解決上述科學(xué)問(wèn)題，我校保護(hù)生物學(xué)江西省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室主任魏輔文院士團(tuán)隊(duì)收集覆蓋中華穿山甲主要分布區(qū)的11個(gè)省份或地區(qū)的94個(gè)樣本開(kāi)展基因組重測(cè)序分析，發(fā)現(xiàn)中華穿山甲可劃分為3個(gè)主要遺傳支系，即MPA，MPB和MPC。其中，MPA分布于青藏高原南部，MPB分布于我國(guó)長(zhǎng)江以南各?。òêＤ虾团_(tái)灣），MPC分布于中南半島東北部（包括越南和老撾）。結(jié)合樣本地理分布信息和物種適宜棲息地分布模擬結(jié)果，推斷MPA與MPB的地理分界線(xiàn)為橫斷山脈，MPB與MPC的地理分界線(xiàn)為亞熱帶與熱帶分界區(qū)。進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn)，MPB支系可進(jìn)一步劃分為兩個(gè)遺傳種群，即分布于云南高原的MPB1和分布于我國(guó)其余省份的MPB2。
圖1 中華穿山甲采樣信息和種群遺傳結(jié)構(gòu)
對(duì)中華穿山甲種群歷史分析發(fā)現(xiàn)，種群間的分化主要受到更新世氣候波動(dòng)的影響。主要表現(xiàn)為中華穿山甲共同祖先約在20萬(wàn)年前出現(xiàn)種群瓶頸和分化，此時(shí)間點(diǎn)對(duì)應(yīng)更新世倒數(shù)第二個(gè)冰期，之后在1萬(wàn)6千年前的末次盛冰期出現(xiàn)種群下降和分化，且適宜棲息地面積也顯著下降。
另一方面，研究團(tuán)隊(duì)綜合評(píng)估了4個(gè)種群的遺傳多樣性、演化歷史、近交水平和演化潛力，并提出了相應(yīng)的保護(hù)管理建議。MPA種群具有最低的遺傳多樣性、最高的遠(yuǎn)期近交水平和最高的遺傳負(fù)荷，表明該種群很可能受到橫斷山脈高山阻隔，導(dǎo)致種群內(nèi)部缺乏基因交流，形成孤立種群，具有較高的滅絕風(fēng)險(xiǎn)；而從其他種群引入新個(gè)體并不會(huì)導(dǎo)致MPA種群的有害變異位點(diǎn)增加，因此建議從其他地區(qū)引入新個(gè)體來(lái)提高M(jìn)PA種群的演化潛力。MPB1種群具有最高的遺傳多樣性、最大的有效種群大小、最小的種群數(shù)量下降幅度和最低的近交水平，是中華穿山甲的重要種質(zhì)資源。MPB2和MPC種群具有最小的有效種群大小、較高的近期近交水平；并且近50年來(lái)其有效種群大小出現(xiàn)急劇下降，與該地區(qū)人口數(shù)量大量增加有關(guān)，表明人為活動(dòng)對(duì)其產(chǎn)生了深刻的負(fù)面影響，因此針對(duì)MPB2和MPC種群，目前的首要任務(wù)是加強(qiáng)就地保護(hù)，恢復(fù)種群數(shù)量。值得一提的是，中華穿山甲種群的有害變異沒(méi)有顯著增加，表明目前采取有效保護(hù)管理措施，仍極具希望使該物種種群復(fù)壯，保護(hù)中華穿山甲為時(shí)不晚！
圖2 中華穿山甲種群演化歷史
該研究系統(tǒng)厘清了中華穿山甲保護(hù)遺傳單元、種群歷史和演化潛力，并提出針對(duì)性的保護(hù)管理建議，研究結(jié)果為中華穿山甲的保護(hù)管理提供重要科學(xué)指導(dǎo)，服務(wù)于中華穿山甲等瀕危旗艦物種保護(hù)的國(guó)家需求。該研究結(jié)果以“Conservation genomics of the critically endangered Chinese pangolin”為題于2024年4月7日在Science China Life Sciences期刊在線(xiàn)發(fā)表，江西農(nóng)業(yè)大學(xué)為第一單位。博士后魏世超為論文第一作者，魏輔文院士為通訊作者。中國(guó)科學(xué)院動(dòng)物研究所樊惠中助理研究員、廣州海洋實(shí)驗(yàn)室周文良研究員、江西農(nóng)業(yè)大學(xué)黃廣平教授、廣東省林業(yè)科學(xué)研究院華彥教授、華南師范大學(xué)吳詩(shī)寶教授、廣西陸生野生動(dòng)物救護(hù)研究與疫源疫病監(jiān)測(cè)中心韋曉科長(zhǎng)、廣州海洋實(shí)驗(yàn)室陳奕廷博士研究生和譚欣悅碩士研究生參與了本項(xiàng)研究工作。廣東省林業(yè)局野生動(dòng)植物保護(hù)處、廣西弄崗國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)管理局劉晟源副局長(zhǎng)、湖南師范大學(xué)彭賢錦教授、廣西師范大學(xué)周岐海教授和范鵬來(lái)副教授、華中師范大學(xué)吳華教授、安徽大學(xué)張保衛(wèi)教授、貴州師范大學(xué)周江教授、西華師范大學(xué)韋偉教授為本研究實(shí)施和樣本采集提供了大量幫助。該研究得到江西省自然科學(xué)基金重大項(xiàng)目、廣東省林業(yè)局野生動(dòng)植物保護(hù)處省級(jí)財(cái)政專(zhuān)項(xiàng)資金、廣東省基礎(chǔ)與應(yīng)用基礎(chǔ)研究基金、珠江人才計(jì)劃等項(xiàng)目資助。
供稿：保護(hù)生物學(xué)江西省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 審核：游金明
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